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Ritorna all'esterno dell'Abbazia.

La disposizione della basilica, con le tre navate, il camminamento e le cappelle radiali, è simile alle grandi chiese di pellegrinaggio in stile francese, cosi come sono la parte ascendente della navata centrale e le decorazioni a rilievo con figure geometriche e fitomorfiche di eccezionele qualità, tra cui spicca il capitello con Daniele e il leone attribuito al Maestro di Cabestany, attivo all'epoca in parecchie città europee. Di derivazione lombarda è invece l'alternarsi fra colonne e colonne cruciformi, così come alcuni degli elementi decorativi, come i capitelli del camminamento e della torre campanaria.

L'interno della chiesa lungo 42,40 m. è a tre navate divise da colonne che, ad ogni gruppo di tre si alternano con un pilastro cruciforme. Bellissimi sono i capitelli, alcuni in onice, tra cui degno di nota, come gia detto, il capitello di "Daniele tra i leoni" (il secondo a destra) attribuito al Maestro di Cabestany.

Il tetto della navata mediana è a travature scoperte, mentre le navate laterali hanno volte a vela. La navata destra è più larga della sinistra ed entrambe si restringono sensibilmente dopo la sesta arcata.

L'abside semicircolare ha la parte superiore che forma la testata curvilinea della navata mediana ed è illuminata da una bifora; la parte inferiore anch'essa semicircolare forma un peribolo aperto per sette arcate verso la navata mediana e che ha verso l'esterno tre absidiole semicircolari.

Nel peribolo, all'interno di due archi ciechi dell'abside sono i due affreschi di Spinello Aretino (inizio XV secolo) che rappresentano Santo Papa e San Sebastiano. In fondo alla navata sinistra è il Campanile, con una cappelletta triabsidata, mentre a fianco della navata destra all'altezza dell'altare maggiore si entra nella sagrestia che presenta affreschi del XV secolo.

A destra dell'altare maggiore si apre una scala che porta ad una piccola cripta rettangolare, la tavola dell'altare della cripta è una lapide sepolcrale romana del 347 d.C.